Trường hợp 1: 02 Sở, ban, ngành hợp nhất, hình thành Sở, ban, ngành mới.
- Sau khi cấp có thẩm quyền quyết định việc hợp nhất 02 Sở, ban, ngành và căn cứ Nghị quyết của Quốc hội quy định việc chuyển tiếp quản lý chương trình, nhiệm vụ, dự án, kế hoạch đầu tư công, Sở Kế hoạch và Đầu tư tham mưu UBND tỉnh trình HĐND tỉnh quy định việc chuyển tiếp quản lý chương trình, nhiệm vụ, dự án và kế hoạch đầu tư công, trong đó đề xuất người đứng đầu của Sở, ban, ngành mới hình thành sau hợp nhất có trách nhiệm thực hiện chức năng, thẩm quyền của chủ đầu tư đối với toàn bộ chương trình, nhiệm vụ, dự án và kế hoạch đầu tư công của 02 Sở, ban, ngành ban đầu. Việc quản lý chương trình, nhiệm vụ, dự án và kế hoạch vốn được thực hiện theo quy định của Luật Đầu tư công và các pháp luật liên quan.
- 02 Sở, ban, ngành ban đầu sẽ thực hiện hợp nhất toàn bộ danh mục chương trình, nhiệm vụ, dự án, kế hoạch vốn thuộc phạm vi quản lý; thông báo cho Sở Kế hoạch và Đầu tư, Sở Tài chính (hoặc Sở Tài chính mới hình thành) để tổng hợp, theo dõi đối với kế hoạch đầu tư công.
Trường hợp 2: Chuyển Sở, ban, ngành này trở thành một bộ phận của Sở, ban, ngành khác.
- Sau khi cấp có thẩm quyền quyết định việc chuyển Sở, ban, ngành này trở thành một bộ phận của Sở, ban, ngành khác và căn cứ Nghị quyết của Quốc hội quy định việc chuyển tiếp quản lý chương trình, nhiệm vụ, dự án, kế hoạch đầu tư công, Sở Kế hoạch và Đầu tư tham mưu UBND tỉnh báo cáo HĐND tỉnh quy định chuyển tiếp thẩm quyền theo hướng người đứng đầu sở, ban, ngành tiếp nhận có trách nhiệm nhận bàn giao toàn bộ danh mục chương trình, nhiệm vụ, dự án và kế hoạch đầu tư công của Sở, ban, ngành ban đầu chuyển sang, thực hiện chức năng, thẩm quyền theo quy định của pháp luật đối với toàn bộ nhiệm vụ, dự án và kế hoạch đầu tư công của cơ quan ban đầu chuyển sang theo quy định của Luật Đầu tư công và pháp luật liên quan.
- Sở, ban, ngành tiếp nhận sẽ thực hiện hợp nhất toàn bộ danh mục chương trình, nhiệm vụ, dự án, kế hoạch vốn thuộc phạm vi quản lý; thông báo cho Sở Kế hoạch và Đầu tư, Sở Tài chính (hoặc Sở Tài chính mới hình thành) để tổng hợp, theo dõi đối với kế hoạch vốn đầu tư công.
Trường hợp 3: 01 Sở, ban, ngành chuyển chức năng, nhiệm vụ về nhiều cơ quan khác.
- Trước khi chuyển giao chức năng nhiệm vụ, người đứng đầu Sở, ban, ngành chuyển giao chức năng có trách nhiệm xác định, phân chia cụ thể danh mục chương trình, nhiệm vụ dự án và kế hoạch đầu tư công theo lĩnh vực chuyển giao, gửi đến Sở, ban, ngành tiếp nhận tương ứng với lĩnh vực chuyển giao.
- Sau khi cấp có thẩm quyền quyết định việc sắp xếp lại tổ chức; Sở, ban, ngành tiếp nhận có trách nhiệm nhận bàn giao danh mục chương trình, nhiệm vụ dự án và kế hoạch đầu tư công theo lĩnh vực nhận chuyển giao và theo phương án phân chi do người đứng đầu Sở, ban, ngành chuyển giao chức năng xác định.
- Sở, ban, ngành nhận bàn giao sẽ hợp nhất danh mục chương trình, nhiệm vụ, dự án và kế hoạch vốn được bàn giao vào danh mục dự án và kế hoạch của mình; thực hiện quản lý kế hoạch và dự án theo quy định của Luật Đầu tư công và thông báo cho Sở Kế hoạch và Đầu tư, Sở Tài chính (hoặc Sở Tài chính mới hình thành) để tổng hợp, theo dõi đối với kế hoạch vốn đầu tư công.
Trường hợp 4: Bàn giao một phần nhiệm vụ từ Sở, ban, ngành này sang Sở, ban, ngành khác; các Sở, ban, ngành không thay đổi pháp nhân sau sắp xếp.
- Sau khi cấp có thẩm quyền quyết định việc sắp xếp, kiện toàn tổ chức, xử lý theo hướng bàn giao nhiệm vụ, dự án riêng lẻ và kế hoạch đầu tư công tương ứng giữa 02 sở, ban, ngành.
- Chủ đầu tư có trách nhiệm xác định tình hình thực hiện, giải ngân, hồ sơ pháp lý dự án để phục vụ việc bàn giao.
- Người đứng đầu sở, ban, ngành tiếp nhận có trách nhiệm tiếp nhận chương trình, nhiệm vụ, dự án và kế hoạch vốn, giao đơn vị trực thuộc làm chủ đầu tư và tiếp tục tổ chức thực hiện.
- Thực hiện điều chỉnh kế hoạch vốn tương ứng giữa 02 sở, ban, ngành. Sau khi hoàn thành việc chuyển giao, Sở, ban, ngành nhận bàn giao có trách nhiệm thông báo cho Sở Kế hoạch và Đầu tư, Sở Tài chính (hoặc Sở Tài chính mới hình thành) để tổng hợp, theo dõi đối với kế hoạch vốn đầu tư công.